Ekotoksikoloji, kimyasallarının ekosisteme olan olumsuz etkilerini araştıran bilim dalıdır. Bu testler toksik kimyasalların, organizmalar üzerindeki etkilerinin incelenmesine ve popülasyon, topluluk, ekosistem ve biyosfer düzeyinde değerlendirilmesini kapsar.
Bu bakımdan ekotoksikoloji, ekoloji, toksikoloji, fizyoloji, analitik kimya, moleküler biyoloji ve matematiğin bir karışımıdır.
Çevremize saçtığımız pestisitler ve diğer kirletici maddeler, şüphesiz ki doğal yaşamı etkilemektedirler. Ekotoksikoloji çalışmaları, kimyasal maddelerin, ürün koruma maddeleri ve biyositlerin, bitki örtüsüne ve hayvan yaşamına olan muhtemel etkilerini incelemektedir. Yapılan araştırmalar göstermektedir ki, pestisit kalıntıları yağışlarla ve rügarlarla taşınabilmektedir. Yani sadece uygulanma bölgesini değil, çok uzak alanları da olumsuz etkilemektedirler.